I tried to plot free energy landscape by using the script (attached), using Mathematica from linux terminal: ./FEL.nb but it did not plot and I see the error message below :
./FEL.nb: linha 1: average-structure.pdb: comando não encontrado ./FEL.nb: linha 3: average-structure.pdb: comando não encontrado ./FEL.nb: linha 4: average-structure.pdb: comando não encontrado ./FEL.nb: linha 6: average-structure.pdb: comando não encontrado ./FEL.nb: linha 8: *CacheID:: comando não encontrado ./FEL.nb: linha 9: average-structure.pdb: comando não encontrado ./FEL.nb: linha 10: NotebookFileLineBreakTest: comando não encontrado ./FEL.nb: linha 11: NotebookFileLineBreakTest: comando não encontrado ./FEL.nb: linha 12: NotebookDataPosition[ 157, 7]: comando não encontrado ./FEL.nb: linha 13: NotebookDataLength[ 13755, 298]: comando não encontrado ./FEL.nb: linha 14: NotebookOptionsPosition[ 13198, 278]: comando não encontrado ./FEL.nb: linha 15: NotebookOutlinePosition[ 13615, 294]: comando não encontrado ./FEL.nb: linha 16: CellTagsIndexPosition[ 13572, 291]: comando não encontrado ./FEL.nb: linha 17: WindowFrame-: comando não encontrado ./FEL.nb: linha 19: average-structure.pdb: comando não encontrado ./FEL.nb: linha 276: fim do arquivo inesperado enquanto procurava por ``' ./FEL.nb: linha 308: erro de sintaxe: fim prematuro do arquivo
Can anyone help me?
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